Francisco Ruiz Fons es licenciado en Veterinaria (2002) por la Universidad de Murcia. Fue becario FPU del MEC en el Instituto de Investigación en Recursos Cinegéticos (IREC – CSIC, UCLM, JCCM), donde consiguió su doctorado en 2006.
Fue contratado postdoctoral de la Junta de Comunidades de Castilla-La Mancha (JCCM), del Instituto de Salud Carlos III en «The James Hutton Institute» (Aberdeen, Escocia; 14 meses) y de Neiker-Tecnalia (Derio, Bizkaia; 24 meses). También fue contratado JAE-Doc del CSIC en el IREC entre septiembre de 2010 y diciembre de 2011, investigador «Juan de la Cierva» del MINECO hasta 31 de diciembre de 2014 e investigador «Ramón y Cajal» desde 1 de enero de 2015 hasta actualidad. En 2018 se incorporó como científico titular del CSIC al IREC, dentro del Grupo de Investigación en Sanidad y Biotecnología (SaBio).
Francisco es autor de 98 publicaciones SCI, 19 publicaciones divulgativas, 11 capítulos de libro y 85 presentaciones a congresos. Ha participado en 23 proyectos competitivos (6 como IP o Co-IP) y en 16 contratos con la Administración Pública y/o empresas (3 como IP).
Sus principales logros científico-técnicos incluyen la identificación de los mecanismos de mantenimiento y transmisión del virus de la enfermedad de Aujeszky en jabalíes y métodos de control, la identificación del papel de la fauna silvestre en la dinámica de infecciones compartidas; la caracterización de los factores determinantes del ciclo de vida y la densidad de vectores como garrapatas (ej. Ixodes ricinus, Hyalomma lusitanicum), mosquitos (ej. Culex pipiens), jejenes (ej. Culicoides imicola) y flebótomos (ej. Phlebotomus perniciosus, Ph. ariasi); la identificación y definición conceptual ejemplificada de los riesgos de emergencia de patógenos con potencial pandémico; y el estudio de técnicas y protocolos para el control de la fiebre Q en el ganado y la fauna silvestre.
Su línea de investigación compagina conocimientos del campo de la ecología, la etología y la evolución con conocimientos propios del campo de las ciencias veterinarias (patología, microbiología, epidemiología, medicina preventiva, diagnóstico) con la finalidad de entender cuáles son los mecanismos por los cuales diferentes grupos de patógenos (de transmisión directa o indirecta o de transmisión indirecta mediada por vectores) se mantienen y transmiten entre diferentes hospedadores originando enfermedades (aproximación «One Health») para diseñar, testar y ofrecer herramientas para su prevención y control.
Francisco ha sido evaluador de proyectos para ANEP y ANR, miembro de la comisión evaluadora del panel «One Health» para la ANR, revisor de 83 artículos científicos internacionales, editor asociado de las revistas «Galemys» y «Frontiers in Veterinary Science«.
Además, ha dirigido 9 trabajos de Máster y 3 trabajos de fin de grado. Es miembro de la Sociedad Española para la Conservación y el Estudio de los Mamíferos (SECEM) y de la «Wildlife Disease Association (WDA)«.